«Летоисчисление от Иоанна» — это повествование о критическом периоде в российской истории, когда происходило противостояние между царем Иваном Грозным и митрополитом Филиппом. Это время было ознаменовано жестокими репрессиями и казнями, связанными с опричниной. Царь вызывает в Москву своего друга детства, игумена Соловецкого монастыря Филиппа. Став митрополитом, Филипп ощущает необходимость защитить тех, кто страдает от насилий, совершаемых по указанию царя и его подручными. Книга «Летоисчисление от Иоанна» написана Алексеем Ивановым на основе первоначального сценария о митрополите Филиппе и царе Иоанне IV «Царь» (идея и режиссура Павла Лунгина, сценаристы Алексей Иванов и Павел Лунгин).